load H:\Term1\PracticeWorks\For_credit2\1eso.pdb script 1eso.def background white rotate x -160 rotate y -5 select all wireframe 40 select cu, zn spacefill set fontstroke 1 set fontsize 12 select hetero and not water label %a select glu7.cg label % CU,ZN SUPEROXIDE DISMUTASE zoom 150 echo these are superoxide dismutase and ions of copper and zinc pause restrict cont_b_m, cu, zn center selected zoom 300 select cont_b_m and *.ca label %r%n echo These are acids bonded to copper and zinc ions pause select bonded_atoms cpk 100 label %a echo These are atoms bonded to copper and zinc ions pause select cont_b_m and not (aa1, aa2) wireframe 20 label off select aa1 and *.ca label % His 61 may be changed echo This residue can be changed with the destruction of link pause select aa2 and *.ca label % His 46 may be changed echo This residue can be changed without destruction of link
Этот скрипт определяет необходимые множества и генерирует пять изображений: 1. Общий вид белка 2. Зона контакта белка с лигандами 3. Атомы, контактирующие с лигандами 4. Остаток, замена которого, возможно, приведет к потере возможности связывания белка с лигандами. 5. Остаток, замена которого, возможно, не приведет к потере возможности связывания белка с лигандами. Скрипт постоянно выводит поясняющие сообщения.